Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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