Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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