Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NAE1Q13564 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms