Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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TCIRG1Q13488 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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TCIRG1Q13488 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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TCIRG1Q13488 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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TCIRG1Q13488 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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TCIRG1Q13488 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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TCIRG1Q13488 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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TCIRG1Q13488 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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TCIRG1Q13488 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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TCIRG1Q13488 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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TCIRG1Q13488 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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TCIRG1Q13488 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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