Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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SCGB2A2Q13296 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SCGB2A2Q13296 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SCGB2A2Q13296 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SCGB2A2Q13296 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SCGB2A2Q13296 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SCGB2A2Q13296 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SCGB2A2Q13296 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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