Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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CLN3Q13286 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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