Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SRSF5Q13243 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF5Q13243 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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