Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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