Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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GPS1Q13098 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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