Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms