Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms