Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms