Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms