Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms