Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms