Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms