Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms