Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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