Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms