Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5F1P24539 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms