Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms