Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms