Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF30P17039 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms