Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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