Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms