Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMC1P11047 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms