Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THRAP10827 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THRAP10827 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THRAP10827 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THRAP10827 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THRAP10827 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THRAP10827 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THRAP10827 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THRAP10827 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THRAP10827 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THRAP10827 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THRAP10827 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.4 ms