Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HKR1P10072 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms