Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TMEM225BP0DP42 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TMEM225BP0DP42 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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