Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA4P06727 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms