Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRATO95237 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRATO95237 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRATO95237 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRATO95237 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms