Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEC24DO94855 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC24DO94855 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SEC24DO94855 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC24DO94855 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC24DO94855 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEC24DO94855 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEC24DO94855 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SEC24DO94855 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC24DO94855 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC24DO94855 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC24DO94855 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms