Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJB3O75712 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJB3O75712 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJB3O75712 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms