Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.3 ms