Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms