Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms