Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms