Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBDO15205 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBDO15205 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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