Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms