Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MCRIP1C9JLW8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MCRIP1C9JLW8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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