Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms