Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms