Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms