Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RCE1Q9Y256 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RCE1Q9Y256 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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