Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SATB2Q9UPW6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SATB2Q9UPW6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms