Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD1BQ9UPS6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms