Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms