Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPO2Q9UMS6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms