Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF11Q9UIL8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms