Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms